膠質(zhì)母細(xì)胞瘤中發(fā)現(xiàn)的全基因組模式可以評(píng)估患者的預(yù)期壽命
發(fā)布時(shí)間:2020-05-25 13:35:23 | 閱讀:次| 關(guān)鍵詞:
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在過去的70年里,膠質(zhì)母細(xì)胞瘤(GBM)——常見、較具侵襲性的腦癌——患者預(yù)期壽命的較佳指標(biāo)就是確診時(shí)的年齡。現(xiàn)在,一個(gè)國(guó)際科學(xué)家團(tuán)隊(duì)已經(jīng)通過實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證了一個(gè)評(píng)估因子,它不僅更準(zhǔn)確,而且更具有臨床相關(guān)性:在整個(gè)腫瘤基因組的數(shù)十萬個(gè)位點(diǎn)上,DNA豐度水平或拷貝數(shù)同時(shí)發(fā)生變化的模式。
全基因組型的患者平均存活時(shí)間為一年。然而,沒有它的病人存活時(shí)間是正常人的三倍,平均為三年。這一結(jié)果來自于今天發(fā)表在《Applied Physics Letters應(yīng)用物理快報(bào)》(APL)生物工程雜志上的一項(xiàng)回顧性臨床試驗(yàn)。
評(píng)估患者的預(yù)期壽命有助于醫(yī)療決策。原則上,GBM模式可以在今天以這種方式使用。例如,當(dāng)病人的磁共振成像結(jié)果不確定時(shí),這些信息可以幫助醫(yī)生決定是否進(jìn)行干預(yù)。
在此模式中,包含的信息和其他模式,我們可以發(fā)現(xiàn)通過使用相同的數(shù)學(xué)方法,可以提高格林-巴利綜合征和其他疾病的標(biāo)準(zhǔn)治療。
個(gè)性化醫(yī)學(xué)
擁有一個(gè)包含整個(gè)基因組的評(píng)估器也可以幫助藥物獲得監(jiān)管批準(zhǔn)。這是因?yàn)槿炕虻睦鄯e效應(yīng)被認(rèn)為與藥物反應(yīng)有關(guān)。
例如,我們希望GBM模式能在未來的臨床試驗(yàn)中識(shí)別出哪些患者將從藥物中受益。即使藥物只針對(duì)一個(gè)基因,病人對(duì)藥物的反應(yīng)也取決于整個(gè)基因組的狀態(tài),而不僅僅是一個(gè)基因。
任何額外藥物的成功批準(zhǔn)都具有意義。例如,在GBM中,在過去的40年里,只有一種藥物,不能治愈GBM,從試驗(yàn)發(fā)展到標(biāo)準(zhǔn)治療。
GBM模式不僅評(píng)估存活,還包括已知的大多數(shù)DNA拷貝數(shù)改變,以及在發(fā)現(xiàn)GBM之前未被識(shí)別的至少同樣多的改變,包括新的可用藥靶點(diǎn)。這使得藥物開發(fā)工作可以直接聚焦于已被證明與患者預(yù)后相關(guān)的基因靶點(diǎn)。
發(fā)現(xiàn)患者預(yù)后和整個(gè)基因組之間的關(guān)系
Alter的團(tuán)隊(duì)是一個(gè)成功識(shí)別GBM腫瘤的DNA拷貝數(shù)和患者預(yù)期壽命之間的關(guān)系的團(tuán)隊(duì),現(xiàn)在他們又進(jìn)行了實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證。然而,研究人員已經(jīng)認(rèn)識(shí)到這種類型的DNA改變是癌癥的一個(gè)多世紀(jì)的標(biāo)志,并在GBM腫瘤中觀察了幾十年。
該團(tuán)隊(duì)通過開發(fā)和使用新的數(shù)學(xué)方法來比較和對(duì)比來自國(guó)家公開數(shù)據(jù)庫(kù)癌癥基因組圖譜(TCGA)的腫瘤和正常全基因組,揭示了這一關(guān)系。以前曾多次嘗試將腫瘤的DNA拷貝數(shù)與GBM患者的預(yù)后聯(lián)系起來,但均以失敗告終,包括以前使用其他方法對(duì)TCGA相同數(shù)據(jù)的研究。
這是一個(gè)包含整個(gè)腫瘤基因組的評(píng)估因子。
新的數(shù)學(xué)方法克服了其他方法沒有克服的三個(gè)明顯的挑戰(zhàn)。首先,他們?cè)谡麄€(gè)基因組的數(shù)十萬個(gè)位點(diǎn)上發(fā)現(xiàn)了一致的模式,這些位點(diǎn)有30億個(gè)核苷酸。二,他們能夠同時(shí)在腫瘤和匹配的正常基因組中做到這一點(diǎn)。三,他們能夠在一小群病人中這樣做,大約100人,這在臨床試驗(yàn)中是很典型的。
“我們的數(shù)學(xué)方法之所以成功,是因?yàn)樗鼈兪褂昧藬?shù)據(jù)集的復(fù)雜結(jié)構(gòu),而不是像通常那樣簡(jiǎn)化或標(biāo)準(zhǔn)化它們,”研究人員表示。“這使得僅在腫瘤基因組中發(fā)生的模式與在正常細(xì)胞基因組中發(fā)生的模式以及由實(shí)驗(yàn)不一致性引起的變異得以分離。”
這些方法可以用于任何類型的數(shù)據(jù),生物或其他。因此,它們可以用于為各種健康狀況(包括傳染病)提供個(gè)性化的治療方法。
膠質(zhì)母細(xì)胞瘤如何提高預(yù)期壽命?
對(duì)于膠質(zhì)母細(xì)胞的治療,巴特朗菲教授表示,手術(shù)切除仍然是主要手段。在通過活組織檢查或影像學(xué)檢查確診后,切除膠質(zhì)母細(xì)胞瘤的治療方法包括盡可能多地切除腫瘤。然而,由于這種癌癥會(huì)進(jìn)入腦組織,所以一般不可能全部切除。因此,還需要額外的治療,如放療、靶向藥物治療和/或化療。
在膠質(zhì)母細(xì)胞瘤切除手術(shù)后,復(fù)發(fā)一般是難以避免的。對(duì)于復(fù)發(fā)后的膠質(zhì)母細(xì)胞瘤,再次手術(shù)仍然是首要選擇。即使考慮到腦外科手術(shù)的危險(xiǎn),包括神經(jīng)損傷或死亡的風(fēng)險(xiǎn),再次手術(shù)也是膠質(zhì)母細(xì)胞瘤復(fù)發(fā)后的主要選擇。
巴特朗菲教授腦干彌漫性膠質(zhì)母細(xì)胞瘤案例一則
研究表明,膠質(zhì)母細(xì)胞瘤患者想要長(zhǎng)期生存多次手術(shù)是必要的
另外相關(guān)研究表明,接受多次手術(shù)的膠質(zhì)母細(xì)胞瘤患者與那些只做一次手術(shù)的人相比,他們可能活得更久。“我們不愿意多次給腦癌患者做手術(shù),因?yàn)槲覀兒ε鲁霈F(xiàn)新的神經(jīng)功能缺陷或傷口愈合不良,很多時(shí)候我們對(duì)這些病人的生存機(jī)會(huì)感到悲觀,”Alfredo Quinones說,“但是這項(xiàng)研究告訴我們,手術(shù)越多,他們存活的時(shí)間就越長(zhǎng)。我們不應(yīng)該放棄這些病人。”
在這項(xiàng)研究中,Quinones-Hinojosa和他的團(tuán)隊(duì)回顧了1997年至2007年接受手術(shù)切除膠質(zhì)母細(xì)胞瘤的578名患者的記錄。在較后隨訪中,354例患者進(jìn)行了一次手術(shù),168例進(jìn)行了兩次手術(shù),41例和15例分別進(jìn)行了3次和4次手術(shù)。接受1、2、3和4次手術(shù)的患者的中位生存期分別為6.8個(gè)月、15.5個(gè)月、22.4個(gè)月和26.6個(gè)月。
Quinones-Hinojosa警告說,他的分析也可能高估了基于病人選擇的多種手術(shù)的價(jià)值,而且有可能那些做得更好的病人,其腫瘤的生物學(xué)特性使他們更容易活得更長(zhǎng)。進(jìn)一步的研究需要證實(shí)他更的結(jié)論。
對(duì)于膠質(zhì)母細(xì)胞瘤重復(fù)手術(shù),國(guó)際顱底腫瘤手術(shù)教授巴特朗菲教授表示,隨著腫瘤體積的縮小,重復(fù)手術(shù)也可能增加放療和化療的療效。每一次連續(xù)的手術(shù),手術(shù)本身在技術(shù)上就變得更具挑戰(zhàn)性,因?yàn)榻馄式Y(jié)構(gòu)的改變,血管被損害,組織變得脆弱。
INC國(guó)際神經(jīng)外科醫(yī)生集團(tuán)提醒:膠質(zhì)母細(xì)胞瘤想要延長(zhǎng)生存期,一次手術(shù)的選擇至關(guān)重要。高切除率的無神經(jīng)功能損傷手術(shù)能夠延長(zhǎng)復(fù)發(fā)周期。因此,選擇技術(shù)高超的神經(jīng)外科醫(yī)生團(tuán)隊(duì)以及前沿的神經(jīng)外科設(shè)備缺一不可。

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